Plongée au coeur de l’ADN Grâce à la montée en puissance des méthodes d’investigation, les scientifiques peuvent désormais explorer le génome de plus en plus finement. Et dévoiler des systèmes d’organisation chromosomique ou des modes de régulation génétique insoupçonnés. Les drosophiles sont des organismes modèles très utilisés en biologie, particulièrement en génétique. Quand les chromosomes se mettent en pelotes… ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Une équipe française, en collaboration avec une équipe américaine, vient de découvrir une nouvelle règle d’organisation spatiale des chromosomes, ces structures d’ADN très condensées qui se trouvent dans le noyau de nos cellules : les chromosomes forment une succession de « pelotes » d’une taille allant de 100 000 paires de bases (les fameuses A, C, G, T) à un million de paires de bases. Mieux, ces pelotes isolent certains groupes de gènes qui interviennent de façon concertée lors d’étapes cruciales du développement de l’embryon, mais aussi à l’âge adulte. En leur sein, on trouve aussi des séquences dites régulatrices qui peuvent contrôler, tels des interrupteurs, l’activité des gènes avec lesquels elles sont en contact, et ainsi coordonner leur activité. Cette découverte lève le voile sur une grande inconnue de la génétique en montrant comment une altération à un endroit du génome peut perturber l’expression de gènes situés à plusieurs dizaines, voire à plusieurs milliers de paires de bases. Nature avril 2012 online Une cartographie 3D des chromosomes Des chercheurs français et israéliens ont révélé pour la première fois l’architecture tridimensionnelle fine des chromosomes. Grâce à l’amélioration d’une approche d’analyse génétique à très haut débit, ils ont dénombré dans le génome de la mouche drosophile 118 millions de zones de contact entre les chromosomes, et ont pu établir des cartes d’interaction très détaillées qui montrent que ceux-ci sont organisés en 1 169 domaines, actifs ou inactifs, contenant chacun un ou plusieurs gènes. Ces travaux devraient permettre de mieux comprendre l’impact de l’organisation 3D des chromosomes sur l’expression du génome. Cell janvier 2012 online 16 Une année avec le CNRS 2012 Séquencer une molécule d’ADN unique en l’étirant Une collaboration franco-américaine vient de montrer expérimentalement la faisabilité d’une nouvelle technique de séquençage de l’ADN reposant sur des mesures mécaniques appliquées à une molécule : en tirant sur les deux extrémités d’un fragment d’ADN replié en épingle, il est possible d’ouvrir la molécule et d’y faire s’hybrider de courtes séquences d’ADN complémentaires pour bloquer de façon transitoire sa fermeture. En mesurant son extension lors de ces blocages, il est alors possible de déterminer la position des hybridations. Nature Methods mars 2012
RA2012
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