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INEE Prospective ecologie chimique

PROSPECTIVE ECOLOGIE CHIMIQUE II .1 Dans l’axe de l’atelier et au-delàI III.1.1 Chimie des produits naturels : Apports et impacts en Écologie chimique La Chimie des produits naturels issus de la biodiversité a subi au cours des vingt dernières années l’influence réductrice du criblage pharmacologique à haut débit. La recherche des substances na- turelles orientée vers le médicament a néanmoins réussi à maintenir cette discipline dans le cur- sus universitaire français, particulièrement dans les filières pharmacochimiques. L’évolution récente de la recherche multidisci- sa place comme acteur privilégié et incontour- plinaire a montré que la Chimie, la Biologie et la nable pour approfondir les connaissances et la Physique doivent s’affranchir des barrières dis- compréhension des relations qui régissent les ciplinaires pour aller vers de nouvelles fron- écosystèmes. Les relations inter- et intra-spéci- tières. Dans ce contexte nouveau, l’Écologie fiques se font par une communication chimique chimique est une formidable discipline pour sa et moléculaire entre individus/espèces vivant au contribution à aborder des questions essen- sein de l’écosystème. Parmi les molécules im- tielles comme les interactions entre espèces et pliquées (sémiochimiques*), les métabolites se- l’influence des variations environnementales sur condaires jouent un rôle essentiel dont le plus ces interactions. connu est celui opérant dans les stratégies de Les messagers chimiques que sont les produits défense contre les prédateurs, comme les alca- naturels, déterminent l’expression de la biodi- loïdes impliqués dans la chimie des communi- versité à l’échelle moléculaire. C’est pourquoi, la cations plantes-mammifères-insectes par leur découverte d’une nouvelle molécule contribue goût amer et leur toxicité. La plupart de ces mé- incontestablement à l’émergence de nouvelles tabolites secondaires ont co-évolué au sein des questions concernant son origine et son action interactions entre les espèces. La diversité chi- en tant que signal biologique. Chaque nouvelle mique des métabolites secondaires est impor- molécule peut constituer un « coup d’envoi » à tante avec plus de 230 000 molécules isolées, des questions fondamentales comme la réacti- caractérisées et répertoriées,mais ce chiffre est vité moléculaire, la séquence biosynthétique faible face au nombre d’espèces végétales, ani- (chimique et génomique) qui la génère,l’impact males, microbiennes, de milieux terrestres et sur les fonctions biologiques ainsi que leurs marins, existantes et capables de produire des régulations. métabolites secondaires. Le métabolome des En clair, la détermination des structures de pro- espèces vivantes est en fait peu connu. Cette duits naturels, toutes origines confondues, richesse est le résultat de l’évolution des es- l’étude de leurs propriétés physicochimiques, pèces, mais les rôles biologiques des métabo- leurs réactivités chimique et biomécanistique lites secondaires et leurs fonctions dans le sont des préalables à leur exploitation pour ré- vivant et les écosystèmes restent encore bien soudre des questions d’Écologie chimique. souvent à découvrir. Ainsi, les études chimiques visant la connais- Les métabolites secondaires interviennent dans sance du métabolome (global ou ciblé) de de nombreux types d’interactions (plante-plante, chaque organisme s’avèrent essentielles. Le dé- plante-animal, animal-animal, animal-environne- veloppement des outils techniques de la méta- ment, bactéries-plantes, bactéries-éponges, bolomique permet aux chimistes de dresser des etc.), au cours de réactions de stress*, et de dé- profils chimiques précis qui peuvent être ren- fense, ou de communication, et le plus souvent seignés sur une base de données des caracté- à des doses très faibles mais très efficaces. La ristiques chimiques de chaque organisme. présence de métabolites secondaires dans des Dans le domaine de l’Écologie chimique, la Chi- espèces spécifiques implique des stratégies mie des produits naturels trouve naturellement métaboliques particulières, des processus de 8


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