Quelques enjeux d’intervention de la Chimie du Vivant en lien avec l’Écologie chimique peuvent être soulignés : • développer l’étude de la diversité chimique • développer les recherches transversales sur le issue de la biodiversitéterrestreet marine. Isole- rôle des médiateurs chimiques dans les écosys- ment et caractérisation structurale de métabolit s tèmes : interactions biotiques,messages molécu- secondaires nouveauxou peu connus(alcaloïdes, laires entre les espèces et leur environnement : saponosides, polycétides, macrolides, hétérocy- substances sémiochimiques,allélochimiques,phé- cles complexes,etc.) ; romones, allélobioses* (cf. Focus 4) ; • comprendre les systèmes biosynthétiques par • utiliser des molécules naturellespour accéder à des approches biomécanistiques,isotopiques et des médiateurs par hémisynthèse ; biomimétiques ; • approfondir les symbioses mutualistes et le • comprendre l’évolutionet la diversification des dialogue moléculaire entre bactéries-plantes, voies de biosynthèse en lien avec la Génomique ; champignons-plantes, bactéries-éponges d’un • moduler et manipuler les voies de biosynthèse point de vue fondamental et à des fins environ- (approches chimiques et génomiques combi- nementales ; nées) ; • utiliser des organismes, des microorganismes • approcher les stratégies d’adaptation des mi- ou des systèmes enzymatiques isolés pour réali- croorganismes et des plantes aux stress créés ser des transformations chimiques (bioconver- pas les activités anthropiques ; sions) de molécules d’intérêt ; • utiliser des produits naturels pour la découverte • développer une Chimie du Vivant éco-inspirée de nouvelles cibles biologiques impliquées dans capable de contribuer à la résolution de pro- l’Écologie chimique ; blèmes environnementaux. II .2 Aux interfaces (ateliers et disciplines)I La réalisation de ces objectifs s’inscrit dans le cadre de recherches interdisciplinaires nécessitant des collaborations étroites et des interfaces multiples : Chimie organique structurale, Synthèse or- ganique fine et durable, Chimie du Vivant, Métabolomique, Physico-chimie des colloïdes, Microbio- logie, Génomique, Transcriptomique, Écologie scientifique globale avec toutes ses différentes sensibilités (chimique, évolutive, microbienne, végétale, conservation-restauration, etc.). POUR EN SAVOIR PLUS Acebey-Castellon I.L., L. Voutquenne-Nazabadioko,H. D. T. Mai, Knappe T.A.,U. Linne, S. Zirah,S. Rebuffat, X. Xie, and M. A. Ma- N. Roseau,N. Bouthagane,D. Muhammad, E. L. M. Debar,S. C. rahiel. 2008. Isolation and structural characterization of capis- Gangloff, M. Litaudon, T. Sevenet, N. V. Hung, and C. Lavaud. truin, a lasso peptide predicted from the genome sequence of 2011. Triterpenoid saponins from Symplocos lancifolia. J Nat Burkholderia thailandensis E264. J Am Chem Soc, 130(34): Prod, 74(2):163–168. 11446–11454. Al-Mourabit A. , M. A. Zancanella, S. Tilvi, and D. Romo. 2011. Langenfeld A., A. Blond, S. Gueye, P Herson, B. Nay, J. Dupont, Biosynthesis, asymmetric synthesis, and pharmacology, inclu- and S. Prado. Insecticidal cyclodepsipeptides from Beauveria ding cellular targets, of the pyrrole-2-aminoimidazole marine al- felina. J Nat Prod, 74(4):825–830, 2011. kaloids. Nat. Prod. Rep., 28:1229–1260. Losfeld G., V. Escande, T. Mathieu, and C. Grison. 2011. Phy- Bergstrom G. 2007. Chemical ecology = chemistry plusecology! toextraction et biodégradation dynamisée : une approche inter- PureAppl Chem, 79:2305–2323. disciplinaire inventive au service de l’environnement. Techniques de l’Ingénieur, IN135:1–8. Eskander J., C. Lavaud, and D. Harakat. 2011. Steroidal sapo- nins from the leaves of Beaucarnea recurvata. Phytochem. Meinwald J. and T. Eisner. 2003. Natural products chemistry: 72(9):946-51. New opportunities, uncertain future. Helv Chim Acta, 86(11):3633–3637. Grison C. and J. Escarré. 2011. Use of metal-accumulating plants for the preparation of catalysts that can be used in che- Poupon B., E. 2011. Nay, editor. Biomimetic Organic Synthesis. mical reactions, International patent WO 2011/064462 and Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA. WO 2011/064487. 11 PROSPECTIVE DE L’INSTITUT ECOLOGIE ET ENVIRONNEMENT DU CNRS
INEE Prospective ecologie chimique
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