V ’ÉCESOGIE CHIMIQUESEUQIMOLOLTLE Prospective Coordinateurs : C. Smadja, C. Lucas, J-C. Caissard Même si les approches dites « Omiques », i.e. techniques permettant d’étudier simultanément un grand nombre de gènes, protéines ou métabolites sans a priori sur leur fonction biologique, ont un apport certain et reconnu par tous dans de nombreux champs de recherche, leur implication dans l'Écologie chimique va au-delà de la simple approche méthodologique technique de Biologie moléculaire dans laquelle on la cantonne trop souvent. Au contraire, les « Omiques » s'imposent de plus en plus comme un champ de recherche à part entière et qui devrait devenir incontourna- ble avec la démocratisation croissante des analyses de séquençage à haut débit. Les « Omiques » ne représentent qu’une étape organismes aux mammifères en passant par les dans la réponseaux enjeux de l’Écologie chimique plantes et les insectes. Il est regrettable de et ont déjà fait surgir de nouvellesquestions. Par noter que les différentes thématiques sont rela- exemple, grâce à la Métagénomique,il est désor- tivement isolées mais cela s'explique par la mul- mais possibled’appréhender les mécanismes di- tiplicité des modèles biologiques et des rectement dans leurs milieux naturels. De plus, questions scientifiques associées, à l'instar de les « Omiques » apportent un nouvel éclairage sur la séparation entre Écologie chimique "terres- les mécanismes évolutifs.Enfin, l’étape post-gé- tre" et "marine". C'est pourquoi la restitution nomique permettra d’élucider la fonction des des discussions de l'atelier prend la forme de gènes,de leurs régulations génétiquesà leurs in- réponses à des questionnements ayant une dé- teractions en réseaux complexes. marche scientifique commune et qui sont asso- Les thématiques sont très variées et se basent ciées à des exemples caractéristiques des sur des modèles biologiques allant des micro- différents modèles étudiés. GÉNOMIQUE TRANSCRIPTOMIQUE PROTÉOMIQUE INTERACTOMIQUE MÉTABOLOMIQUE Séquençage de Séquençage de génomes entiers transcriptomes entiers Séquençage ciblé Puces à ADN Génotypage et tiling arrays Figure 4 : Les techniques « Omiques » 16
INEE Prospective ecologie chimique
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