La taxomomie intégrative s’avère particulièrement intéressante pour résoudre des complexes d’espèces dans des groupes taxonomiques difficiles (ici octocoralliaires, lichens, plantes ou éponges), et ainsi décrire des espèces cryptiques. Dans le cas des éponges Homoscleromopha sp. l’absence des caractères fondamentaux de la systématique de ce groupe (squelette de spicules) a stimulé l’utilisation de six jeux de données diffé- rents pour décrire une nouvelle éponge du genre Oscarella Focus 7 : Taxonomie intégrative (d’après Cardenas et al., 2012) La combinaison de plusieurs types de caractères croisant le cercle à l’aide de jeux de données indé- complémentaires pour évaluer le statut d’une es- pendants. Ces jeux de données sont traditionnelle- pèce est appelée Taxonomie intégrative. Elle est ment morphologiques et moléculaires, mais aujourd’hui considérée commel’approche la plus ri- d’autres caractères sont de plus en plus fréquem- goureuse en Systématique,recommandant un mi- ment utilisés (e.g. cytologie, symbiontes proca- nimum de trois types de caractères taxonomiques ryotes, reproduction, écologie). Parmi eux, les différents. Le « cercletaxonomique» (DeSalleet al., marqueurs chimio-taxonomiques peuvent être par- 2005) est une façon d’illustrer comment la taxo- ticulièrement informatifs, et les signatures méta- nomie intégrative fonctionne. Les lignes qui traver- bolomiques offrent aujourd’hui des perspectives sent le cercle indiquent les différentes voies d’application nombreuses dans la mesure où elles possibles pour vérifier des hypothèses taxono- ne nécessitent pas obligatoirement l’isolement et miques. Pour créer un nouveau taxon, il est néces- la caractérisation des composés chimiques pour saire de confirmer l’hypothèse taxonomique en donner une indication pertinente. VI.6 comprt hensionétabolomiquemes de l’adaptationalàsinacémsedMaledéroppA Toute modification de l’environnement constitue génétiques et phénotypiques (plasticité phénoty- une source potentielle,nouvelle ou intensifiée,de pique) reste toujours difficile. Or,les mécanismes sélection directionnelle sur des traits importants de l’adaptation opèrent du gène à l’organisme et pour la valeur sélective d’une espèce. A la com- se répercutent jusqu’à l’écosystème. Le méta- binaison de pressions de sélections fortes (no- bolome constitue un niveau clé, quoique encore tamment dans le cadre du changement global peu utilisé, dans l’étude des mécanismes de actuel), les organismes peuvent répondre de l’adaptation. En effet un facteur de stress peut façon intégrative par des réponses adaptatives induire une modification de la production des mé- (e.g. ajustements physiologiques, processus tabolites secondaires, qui, compte tenu de leur micro-évolutifs). Ces actions synergiquespeuvent rôle majeur dans l’organisme (notamment dé- faire varier l’état de stress physiologique des or- fense chimique et survie) peut conduire à une ganismes et des populations, et éventuellement modification de la valeur sélective. affecter en retour le potentiel adaptatif des es- Aujourd’hui, la démocratisation de la Métabolo- pèces aux changements environnementaux mique et des nouvelles technologies de sé- contemporains. Cependant on connaît mal les quençage appliquées au génome et au mécanismes par lesquels la combinaison de fac- transcriptome permet d’accéder de façon très teurs de stress environnementaux est traduite en complète à la quasi-totalitéde ces niveauxd’or- une réponse physiologique,modifiant ainsi la va- ganisation et par là-même d’envisager une ap- leur sélective en milieu naturel. De même distin- proche intégrative amenant à une connaissance guer les parts respectives des réponses approfondie des mécanismes de l’adaptation. 29
INEE Prospective ecologie chimique
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