nismes. Des développements de modules infor- terme la diffusion des données publiques. Il est à matiques sont encore prévus (adjonction de do- noter que l’application Cantharella sera prochai- cuments, bibliothèque de molécule, SIG, etc.). nement diffusée sous licence libre (http://sour- Ceci étant, l’application Cantharella est pleine- ceforge.net/p/cantharella/home/Cantharella/), ment fonctionnelle et actuellementutilisée pour avec comme objectif d’élargir la communauté des partager et pérenniser l’information scientifique utilisateurs et de rassembler des développeurs entre équipes d’un même projet. Elle permettraà autour du projet. La base de données collaborative du projet ANR Ecimar Cette base de données a été initiée en 2007 base de données ont été acquises selon un pro- pour réunir les données recueillies au cours des tocole standardisé, et complétées par les carac- campagnes d’échantillonnage du projet ANR térisations structurales de composés et des d’Écologie chimique marine ECIMAR. Pour tests de bioactivité. Cette base a été alimentée chaque échantillon récolté, elle comporte des par les différents partenaires du programme, et données de taxonomie, des illustrations des or- elle recense actuellement plus de mille échan- ganismes in situ (éponges, cnidaires en majo- tillons prélevés sur environ 200 espèces ma- rité), et les signatures chimiques acquises selon rines. La structure de la base de données est plusieurs détecteurs. Elle regroupe aussi les in- évolutive, et elle va d’ailleurs servir à la création formations concernant les lieux d’échantillon- d’une base de données « fille » pour la gestion nage et la localisation précise des prélèvements. d’autres programmes de recherche (e.g. projet Les signatureschimiques regroupéesdans cette européen « Bammbo »). L’EcoChimiothèque du GDR 2827 d’Écologie chimique (http://ecochimiotheque.cefe.cnrs.fr). Cette base de connaissances, initiée en 2010, a ainsique les données physico-chimiques,analyses pour objecti de fédérer,classer et permettred’ana- chimiques effectuées sur ces échantillons,dispo- lyser les informations biologiques, chimiques et nibilité et accessibilité par synthèse chimique. physico-chimiques disponibles dans le domaine Développée sur la base de l’application de « chi- des médiateurs chimiques. Elle permet aux chi- miothèque départementale » de la Chimiothèque mistes et écologues de partager leurs informa- Nationale (pour lui assurer une pleine compatibi tions liéesà la taxonomie, aux lieux et techniques lité), elle est actuellement en phase de tests et de prélèvement ou de traitement de l’échantillon devrait être alimentée dès 2012. La Chimiothèque Nationale (http://chimiotheque-nationale. nscm.fr). Née au début des années 2000 de plusieurs ini- informations (structure chimique, propriétés phy- tiatives individuelles, la Chimiothèque Nationale sico-chimiques, données pharmacologiques, etc.) est aujourd’hui un GIS, auquel adhèrent 34 éta- concernant les molécules et extraits disponibles blissements d’enseignement supérieur ou orga- sont regroupées dans deux bases de données in- nismes de recherche (Directeur: Marcel Hibert). terrogeables via le WEB. En juin 2011, la CN ré- Elle est représentée dans cet atelierpar Philippe férençait 46000 substances et 14500 extraits, Jauffret, directeur de l’UGCN (UPS 3035 du tous libres de droits et disponibles. Ces produits CNRS),unité support du GIS CN. La Chimiothèque sont conditionnés en vrac ou en microplaques de Nationale a pour mission principale de regrouper 96 puits (ou les deux),afin de permettre leur éva- les collections de produits de synthèse,de com- luation biologique, ciblée ou systématique. L’I SN posés naturels et d’extraitsnaturels existant dans et le MNHN sont les principaux contributeurs des les laboratoires publics français et d’en promou- collections de composés et d’extraits naturels de voir la valorisation scientifiqu et industriele. Les la Chimiothèque Nationale.e 37
INEE Prospective ecologie chimique
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