PROSPECTIVE ECOLOGIE CHIMIQUE Thématiques émergentes En Écologie chimique comme dans beaucoup de Données (SGBD) sont généralementhomogènes domaines, les bases de données sont devenues et principalement articulés autour de la norme un outil central et essentiel dans la gestion des SQL, les interfaces de connexion font appel à données scientifiques. Les technologies ac- toute une multitude de technologies et de lan- tuelles permettent de stocker des informations gages informatiques. de nature très variable, de les rendre accessible Un second écueil des progrès technologiques ap- à distance et ainsi de les partager immédiate- portés aux méthodes de travail en recherche ment avec des collaborateurs. Ces progrès tech- scientifique (dans tous leurs aspects) est que la nologiques ont permis à diverses équipes quantité de données à traiter est devenueconsé- d’organiser plus efficacement leur programme de quente. Pour faire face à ces flots d’informations recherche en permettant un meilleursuivi de leur et arriver à les interpréter de manière pertinente, état d’avancement ou parfois en offrant un outil des outils statistiques sont en cours de dévelop- d’aide à la rédaction de rapports. En tâche de pement ou d’utilisation pour les plus avancés fond, la centralisation des données au sein de (MSEASY ou XCMS par exemple pour le traite- bases de données permet une pérennisation de ment assisté de données d’analyses chimiques). ces données scientifiques par la sauvegarde Ces outils doivent permettre de gérer au mieux massive et automatisée rendue possible par l’ac- les différentes sources de données et se confron- croissement des capacités de stockage des tent souvent à un obstacle majeur : il n’y a pas de disques durs. Il faudra tout de même veiller à norme associée au format des fichiers de sorties mettre à jour les formats de donnéesafin de per- générés par les machines, en particulier,pour ce mettre leur lecture dans les annéesfutures et ne qui nous concerne, dans le domaine de l’analyse pas se laisser dépasser par l’évolution des chimique ou du séquençage. normes de fichiers. Par ailleurs, le rapprochement de ces bases en Une contrepartie importante à ces déploiements Écologie chimique avec l’initiative d’inventaire et facilités de bases de données est que chacun a de gestion des bases de données réalisée par pu, personnellement ou dans le cadre de son INEE est en cours, en particulier avec la création équipe de travail, développer sa propre base depuis septembre 2011 d'une Unité Mixte de conduisant a un morcellement de l’information Service (UMS 3448, CNRS-MNHN) Bases de don- au sein de multiples bases de petite taille. De nées Biodiversité, Ecologie, Environnement et So- plus, si les Systèmes de Gestion de Bases de ciétés (BBEES). 38
INEE Prospective ecologie chimique
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