L’analyse chimique des sols est un bon exemple. différentes sur un même site et de disposer d’une Cette analyse est peu développée, même si son forte puissance statistique. importance est reconnue. Ce domaine présente L’expérimentation in situ en milieu naturel, com- des difficultés particulières, notamment dans plémentaire de l’observation et de l’expéri enta- l’étude des composés volatils ou des micro-élé- tion en environnement contrôlé, reste une étape ments (sélénium, soufre, calcium, etc.), ou même clé pour la définition et la validation des modèles. dans l’analyse desfacteurs abiotiques,commeles Des stations instrumentées d’écologie expéri- rapports stoechiométriques des éléments (C:N:P), mentale avec des suivis des paramètres chi- sur la libération des médiateurs chimiques, alors miques et biologiques de l’environnement sont que l’enjeu en agriculture ou dans la lutte contre nécessaires. les feux de forêt estimportant.Parexemple,l’ana- Un effort important doit être apporté au dévelop- lyse d’activités métaboliques dans le sol par IR ou pement de capteurs qui permettront de compléter l’analyse des substances à très faibles concen- les stratégies d’observation en continu de la bio- trations ou faisant intervenir les micro-éléments diversité et de la dynamique des écosystèmesen (GC-ICP-MS et LC-ICP-MS) devraitêtre développée. y ajoutant des traceurs des relations réciproques L’établissement de stations expérimentales et de entre l’activité des organismes et conditions envi- sites d’expérmentationsen milieu contr lé de type ronnementales. écotron (macro-, méso- et microcosmes) ou cham- De plus nombreu es plateformestechniques(avecs bres d’enfermement sont à favoriser. En effet des ingénieurs spécialisés),dédiées à l’Écologie l’analyse multimodale et multitemporelle de com- chimique, seraient à promouvoir afin de facilter le munautés souvent complexes et de leurs émis- développem ntde cette communaut scientifque.e sions en lien avec les nombreuses variables En effet bon nombre de technologiede pointe ou abiotiques, effet du stress, suivi temporel des très coûteuses (RMN, LC-MS, GC-MS-MS par ex.) émissions, nécessiterait l’emploi fréquent de ce sont inaccessibles, ou tout du moins difficil ment type d’outils. Les écotrons (voir aussi le Focus 8 accessibles,auxécologues.L’i itiative d’unréseau p.42) permettent de travailler sur des écosys- de plateaux techniques mutuali és dans le grand tèmes complexes et réalistes,à des échelles très ouest (Metabo-Mer) est un exemple à suivre. X.2 Dans le domaine des « Omiques » et de la Métabolomique a. Promouvoirla mise en place de plateaux de métabolomique performants (RMN haut champ,UPLC, HRMS équipés pour le haut débit) dédiés à des applications en Écologie (notamment en marin),et le recrutement de personnels spécialisés ; b. Faciiter l’accès au séquençage des espèces non modèles dans les plateformes nationaleset ré- gionales de séquençage. L’essor des nouvelles techniques « omiques » à l’interface de l’Écologie microbienne et de la est une opportunité unique pour le développe- Géochimie, a permis l’essor de nouveaux outils ment de l’Écogéochimie. Ces techniques per- d’analyse microgéochimique et d’imagerie. mettent d’aborder sur des bases qualitatives et XANES (spéciation chimique via les techniques quantitatives la complexité des réseaux d’inter- liées au synchrotron), SIMS (isotopie à l’échelle action écogéochimique. Largement utilisés pour cellulaire) combinées aux techniques d’imagerie les communautés de procaryotes grâce aux pla- moléculaire (FISH) ont permis de décrire la struc- teformes de séquençage génomique ou de pro- turation spatiale des communautésmicrobiennes téomique, l’utilisation de ces outils doit encore en parallèle à la distribution de traceurs(isotopes être élargi à des communautés plus complexes, stables, structure minéralogiques et gradient incluant la meiofaune, et pour accéder à toute la redox à échelle nanométrique. Ces techniques gamme d’activités métaboliques et de réponse lourdes sont développées et opérées à partir de aux stress. plateformes sous la gestion d’autres commu- Le développementrécent de la Géomicrobiologie, nautés (Physique, Biologie). 41
INEE Prospective ecologie chimique
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