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27.09.12

« France-Génomique » recherche un Ingénieur bioinformaticien en contrat CDD, pour sa plate-forme de Nice/Sophia Antipolis (06), en charge du développement des analyses biostatistiques .

Lieu de travail : IPMC (UMR7275), campus de Sophia Antipolis (06), http://www.genomique.info/
Durée : 18 mois, renouvelable. Début du contrat possible à partir du 01/12/2012.
Salaire : suivant expérience, basé sur la grille indiciaire du CNRS

Le poste est ouvert dans le contexte de la participation de la plate-forme de Génomique Fonctionnelle de l’IPMC de Sophia Antipolis à l’infrastructure France-Génomique. Au sein de la plateforme, le candidat participera au maintien et au développement d’outils permettant la gestion et l’analyse statistique de données issues du séquençage haut débit (étude de l’expression, régulation génique,..).

Missions
1. participer à l'organisation des différents flux de production de données issues de la plate-forme, en lien étroit avec les autres sites partenaires du projet, afin de mutualiser les procédures d’analyse et fournir un service homogène sur l’ensemble des plates-formes productrices de données,
2. répondre aux demandes d’analyses et assurer le suivi biostatistique des projets auprès des collaborateurs de la plate-forme.
3. participer à l'évolution des méthodes bioinformatiques utilisées pour l’analyse de ces projets (création de nouveaux outils biostatistiques sous environnement R/bioconductor).

Activités
En liaison étroite avec les bioinformaticiens et les biologistes de la plate-forme, réaliser et mette en œuvre des applications permettant un rendu de résultats compatible avec le cahier des charges définis par France Génomique.
Conduire le déploiement d’applications,
Participer à l’activité de la plate-forme,
Assurer la veille technologique en relation avec les experts du domaine,
Rédiger des sections des articles scientifiques liées à la méthodologie statistique,
Assurer le respect des normes Qualité et des réglementations en vigueur (certification ISO 9001).

Compétences
- Expérience réussie en bioinformatique, de préférence dans le domaine du séquençage à haut débit, de la génomique, des données d'expression.
- Connaissance opérationnelle des techniques de programmation :
o Bonne connaissance de Windows, Unix/Linux, Shell, R (www.r-project.org/), PYTHON, PERL
o JAVA (J2EE) serait un plus.
o Maitrise des SGBD de type MySQL/PostGreSQL.
- Capacités organisationnelles, présentation synthétique et didactique des résultats scientifiques,
- Maîtrise de l'anglais scientifique à l’oral et à l’écrit.

Diplôme exigé
Le candidat devra être au moins titulaire d'un BAC+5 en informatique, avec de fortes compétences en biologie et statistiques. Autonome et rigoureux, avec un sens de l'organisation qui permet de mener un projet ambitieux impliquant des personnes localisées sur plusieurs sites.
Excellentes qualités relationnelles, d'écoute et de communication (à l'oral comme à l'écrit).
Goût pour le travail d'équipe et le partage des connaissances.
Esprit d'initiative, curiosité, créativité technique.

Les candidatures (lettre de motivation + CV, incluant une liste de personnes de référence) doivent être envoyées avant le 1er novembre 2012, par mail à l’attention de :
Pascal Barbry , Directeur - Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire -
660, route des lucioles
- F06560 Sophia Antipolis - tel: +334 93 95 77 93