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Omiques Environnementales – ENVIROMICS

Année de démarrage : 2014

Contexte : Les nouvelles générations de séquenceurs (NGS) de l’ADN ont ouvert des perspectives encore insoupçonnées il y a quelques années pour accéder à la diversité génétique du vivant, que ce soit sa description (code barre, metagénomique, phylogénie moléculaire) ou sa compréhension tant évolutive que fonctionnelle (génomique évolutive, génétique des populations, écologie moléculaire, écologie des communautés). Au delà de la génomique et son support ADN, les avancées technologiques assurant la production de données biologiques à haut débit concernent l’ensemble des molécules du vivant : ARN et (méta)transcriptomique, protéines et (méta)protéomique, ainsi que les constituants métaboliques et structurels des organismes avec la métabolomique, c’est-à-dire l’ensemble des technologies omiques. Cette révolution change de plusieurs ordres de magnitude l’accès à de nouvelles données environnementales. Ces outils NGS en appui de données environnementales physico-chimiques et biologiques, ou encore archéologiques et d’archives, permettent d’intégrer les différentes échelles biologiques (du gène à la communauté) et écosystémiques (variations spatio-temporelles) des environnements actuels et passés (écologie rétrospective). Les technologies omiques soulèvent également des interrogations sociétales fortes quant à l’utilisation des données qui mettent à nu les patrimoines génétiques du vivant et des populations humaines actuelles et passées. Les données omiques génèrent également un flux de données dont le volume de production se fait au détriment de sa qualité et de sa fiabilité avec des risques importants de mauvaises interprétations scientifiques et sociétales. Ces bouleversements techniques, scientifiques et sociétaux se déroulent dans un contexte mondialisé et extrêmement concurrentiel pour la production, la valorisation, et le partage de ces nouvelles connaissances.

Objectifs : Un défi majeur est l’émergence d’approches pluridisciplinaires pour l’étude des objets et questions relevant des omiques environnementales.

Les attendus de ce défi ENVIROMICS sont :
-de dynamiser et systématiser des approches pluridisciplinaires pour l’étude des écosystèmes, de la biodiversité, de son évolution et son fonctionnement ;
-de créer et consolider de nouvelles chaines pluridisciplinaires de production, d’exploitation et de valorisation des savoirs et savoir-faire issus des approches omiques environnementales au sein du CNRS ;
-de structurer des consortiums nationaux propices au montage de projet interdisciplinaires à retombées nationales et/ou internationales.

Pour accéder aux projets renouvelés en 2016
PDF - 83.2 ko

Pour connaitre les projets et les actions soutenus en 2014 et en 2015

Pour obtenir des informations :
Dominique Joly (responsable scientifique de l’action)
La Mission pour l’interdisciplinarité