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Microbiologie fondamentale

Directeur scientifique : Michel Van der Rest
Directeur du programme : René Bally
Contact : René Bally - mail1, mail2

 

Ce programme de recherche interdisciplinaire "Microbiologie Fondamentale", suscité par l'ancien département SDV du CNRS, créé en avril 2003 pour une durée prévisionnelle de quatre ans, fait suite aux réflexions engagées par la communauté des microbiologistes en réponse aux nombreuses questions posées par la société non seulement dans le domaine de la santé humaine, animale et végétale, mais aussi dans le domaine de l'environnement et de l'écologie.

 

De ces réflexions, il ressort qu'il est urgent :

• de soutenir la recherche fondamentale en favorisant l'étude des mécanismes moléculaires sous-jacents au fonctionnement de la cellule,
• d'étudier le comportement des micro-organismes dans leur environnement, au niveau même des mécanismes moléculaires des interactions entre ces micro-organismes (qu'ils soient pathogènes ou non) et leur hôte (l'homme, l'animal ou la plante),
• d'analyser et de préserver la biodiversité microbienne.

 

Pour répondre à la fois au développement des connaissances et à l'urgence de la demande sociale, une fusion du programme "Microbiologie Fondamentale du CNRS" dans une action plus large avec Ministère de la Recherche et des Nouvelles Technologies a été réalisée .

Un programme de recherche interdisciplinaire de Microbiologie intitulé, "Microbiologie Fondamentale et Appliquée, Maladies Infectieuses, Environnement et Bioterrorisme", a été mis en place en partenariat avec l'INRA, l'INSERM et le Ministère Délégué à la Recherche et aux Nouvelles Technologies, en liaison avec la Direction Générale de la Santé.

Ce programme inter-organismes est dirigé par un Comité de Pilotage qui s'appuie sur un Conseil scientifique et une Cellule de Coordination Scientifique.

Dans ce programme seront considérés les projets ayant trait à la microbiologie (bactériologie, virologie, mycologie, parasitologie, biologie des vecteurs) humaine, animale, végétale et environnementale. Un effort particulier est envisagé dans le soutien des actions visant la recherche concernant les agents infectieux émergents ou ré-émergents et les agents de la menace bioterroriste.

 

Cinq axes de recherche ont été retenus :

Axe 1 - Microbiologie fondamentale

• Etude des microorganismes sur les plans structural, moléculaire, taxonomique, phylogénique et évolutif.
• Connaissance de la biodiversité, notamment au niveau des génomes et de la physiologie microbienne (aspects génomiques et post-génomiques)

Axe 2 - Mécanismes d'interaction des microorganismes avec leurs hôtes (cellules, organismes)

• Caractéristiques des équilibres symbiotiques et des associations préférentielles (commensalisme) ;
• pathogénie des infections microbiennes humaines, animales et végétales.

Axe 3 - Environnement

• Interactions des écosystèmes microbiens chez l'homme, l'animal et les plantes, dans les environnements naturels et anthropisés, co-évolution hôte-microbe, communication microbienne au sein d'écosystèmes, rôle de la diversité dans le fonctionnement des écosystèmes, perturbation des écosystèmes, co-infections ;
• sélection et émergence de la résistance aux agents anti-infectieux.

Axe 4 - Moyens de prévention des infections et de lutte contre les agents pathogènes, y compris l'amélioration des techniques diagnostiques (notamment contre les pathogènes émergents ou ré-émergents)

• Chimioprophylaxie, immunoprophylaxie, thérapeutique, mécanismes de résistance.

Axe 5 - Bioterrorisme

• Recherche à objectifs finalisés (détection, prophylaxie, traitement) concernant les agents des catégories A et B selon la classification du CDC.