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FOCUS 12-2 (Suite) Les résultats montrent qu’à l’Estaque, le cycle du soufre est central au modèle et couplé à la fermentation et au cycle de l’arsenic (Figure 12C). La fermentation fournit aux bactéries sulfato-réductrices, les donneurs d’électrons nécessaires à la réduction du sulfate. Les sulfures produits réagiraient avec l’arsenic, formant des composés thioarseniés observés expérimentalement et précipitant avec les métaux. Les complexes thioarseniés étant très solubles, ils favorisent donc sur ce site la dispersion de l’arsenic vers la colonne d’eau. Industrial activities Ce projet souligne qu’au delà des résultats biologiques il est envisageable d’étudier des méta-génomes complexes même avec une couverture faible et sans assemblage, à condition de se Oxidation placer au niveau fonctionnel pertinent (processus biologiques). Dans ce cas, le métagénome est considéré comme un supra-organisme dont on étudie le métabolisme global. Une com-paraison directe ne donnant qu’une image partielle, l’utilisation de contrôles adéquats est 2- une nécessité pour la comparaison de métagénomes proches. Idéalement, les contrôles ne devraient contenir que les processus ubiquitaires pour ne pas masquer des processus intéres-sants. Il manque ici des standards, sorte de moyenne sur les grandes catégories d’environne-ment, permettant de se focaliser sur les données pertinentes. Il serait également intéressant de passer du modèle descriptif à un modèle plus rigoureux, qui permettrait d’étudier plus précisément les relations entre les différents cycles et les effets des différents processus sur la dispersion de l’arsenic. Oxidation Chromatiales PROSPECTIVE DE L’INSTITUT ECOLOGIE ET ENVIRONNEMENT DU CNRS 87 SO4 HS-O3 S 2- 2 HCO- 3 H2 CH4 Metal2+ Metal-S As(III) As(V) Respiration Reduction Carboxylic acids Nitrate metabolism Organic-Matter Dissimilatory Sulphate reduction Methanogenesis Chromatiales Other SOB - Aminoacids urea NH3 Purines - NO3 N2 N2O NO NO2 Fermentation Metabolite salvage N-compound catabolism CO2 Methylamines Methanol Response to arsenic Bacteriochlorophyll Carotenoids Oxidative stress Metal2+ metal transport Arsenic transport As(III) urea urea transport L'Estaque Thioarsenical compounds & As2S3 2- SO4 HS-O3 S 2- 2 HCO- 3 H2 CH4 As(III) Respiration As(V) Reduction Carboxylic acids Nitrate metabolism Organic-Matter Dissimilatory Sulphate reduction - Aminoacids urea NH3 Purines - NO3 N2 N2O NO NO2 Fermentation Metabolite salvage N-compound catabolism CO2 Methylamines Methanol urea transport urea C fixation Bacteriochlorophyll Carotenoids Metal2+ Metal2+ metal transport Metal-S St Mandrier Anthropic activities S cycle S cycle Figure 12C. Comparaison des cycles biogéochimiques par analyse métagénomique de deux sites méditerranéens pollués par les métaux lourds. A gauche, ancien site métal-lurgique de l’Estaque, à droite, station de Saint-Mandrier. Saint-Mandrier


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