d’une très forte diversité d’entités rares (« the rare biosphere »). A l’échelle de l’océan global il pourrait bien y avoir plusieurs millions d’espèces marines, si l’on tient compte des organismes unicellulaires (Figures V.1, V.2). Les inventaires exhaustifs de la biodiversité marine, des virus aux métazoaires, sont extrêmement rares, même à l’échelle locale. En effet les communautés scientifiques des micro et macro-biologistes sont encore trop disjointes et les concepts mêmes de biodiversité diffèrent suivant les grandes catégories du vivant : biodiversité essentiellement génomique chez les virus, métabolique chez les bactéries et archées, organismique chez les eucaryotes uni- et pluri-cellulaires. Les concepts d’espèces et de populations suscitent de vives discussions à propos des virus et des procaryotes, et sont encore très peu connus chez les protistes, alors que les concepts de réseaux métaboliques supra-spécifiques et de pan-génomes sont rarement abordés chez les eucaryotes pluricellulaires. Or, étant donné la relative complexité et l’extrême intégration des réseaux de biodiversité marine, il est crucial de casser les barrières conceptuelles et parfois méthodologiques entre les différentes communautés de biologistes marins si l’on souhaite comprendre les processus à l’échelle écosystémique, en intégrant l’ensemble de la biodiversité. Sur quelles catégories appréhendons-nous la biodiversité ? Une réflexion globale sur la question montre que toutes ces catégories sont arbitraires : elles répondent au besoin de rationalité, d’action ou d’exploitation de l’observateur. Le « cahier des charges » moderne de nos classifications, fixé par Charles Darwin en 1859, n’est ni écologique, ni culinaire : c’est l’apparentement qui régit la légitimité des catégories que nous fabriquons en systé- Figure V.1 - Diversité du plancton Figure V.2 - Capture du benthos à partir d’une barge sur le littoral de Terre Adélie (Antarctique). 54 prospective mer
prospectivemer2013
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