Des chercheurs du
Genoscope (Institut Génomique/CEA/CNRS) et de l’Institut Pasteur ont re-séquencé le génome de
Bacillus subtilis avec l’une des dernières technologies de séquençage, le pyroséquencage, et prédit, de novo, la fonction des gènes en utilisant la plateforme d’annotation «MicroScope» (Interface graphique MaGe).
Le génome de cette bactérie modèle avait été séquencé une première fois en 1997 par un consortium composé de 30 laboratoires. Mais ces premiers travaux présentaient des expertises de qualités inégales qui ralentissaient l’avancée de nombreux domaines inférant à ce modèle, comme la phylogénie, la génétique bactérienne, l’étude des bactéries pathogènes (staphylocoques, streptocoques) et la recherche de biocatalyseurs pour l’industrie (amylase pour le pain, protéases pour les détergents, etc.). Une validation expérimentale de la fonction des gènes, prédite par comparaison de séquences, devrait, par la suite, confirmer les annotations expertes/manuelles du génome de B. subtilis.
Contact : Claudine Médigue, chef de laboratoire de génomique comparative (UMR8030) - 01 60 87 84 59.