© Erwan AMICE / LEMAR / CNRS Images

PEPR Génomes marins (ATLASea)

Décrypter les génomes marins pour préserver et innover

À travers le programme de recherche ATLASea, la France engage une exploration sans précédent de sa biodiversité marine, en séquençant le génome de milliers d’espèces vivant dans les espaces maritimes placés sous sa souveraineté. Son objectif est de constituer une base de connaissances inédite pour étudier l’évolution, les mécanismes biologiques et les interactions entre espèces, tout en appuyant des stratégies de protection de la biodiversité.

  • PEPR exploratoire
  • Pilotes du programme : CEA, CNRS
  • Directeurs de programme :
    • Hugues Roest Crollius - CNRS (Institut de biologie de l'École Normale Supérieure (IBENS))
    • Patrick Wincker - CEA
  • Budget : 41 M€
  • Durée : 8 ans (2023 à 2031)

Ce programme mobilise des expertises en biologie, écologie, génomique, bioinformatique et taxonomie. Grâce aux avancées technologiques en séquençage, il devient possible d’explorer finement les caractéristiques génétiques d’un grand nombre d’espèces, dont beaucoup restent peu connues ou jamais étudiées à ce niveau. Cette exploration génétique permettra de retracer l’évolution des organismes marins, d’élucider leurs mécanismes d’adaptation et d’éclairer les liens entre les différentes formes du vivant. Les données recueillies seront partagées en libre accès, constituant une ressource unique pour la recherche mondiale en biologie et en écologie.

Les applications attendues sont nombreuses : identification de molécules naturelles aux propriétés thérapeutiques, de nouvelles voies métaboliques utiles à la santé, à l’agroalimentaire ou à la dépollution, et découverte d’enzymes capables de dégrader les polymères de synthèse ou de résister à des conditions extrêmes. En favorisant une meilleure compréhension des écosystèmes marins, ATLASea contribuera à concevoir des stratégies innovantes de préservation et de gestion des populations d’espèces d’intérêt - exploitées, menacées ou invasives - essentielles à l’équilibre de la planète et au bien-être des sociétés humaines.

Site web du PEPR ATLASea

Page LinkedIn du PEPR ATLASea

Participation des structures de recherche aux projets

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ATLASea fait partie des lauréats des PEPR (Projets et Équipements Prioritaires de Recherche) exploratoires, qui visent des secteurs scientifiques ou technologiques en émergence pour lesquels l’État souhaite identifier et structurer ces communautés. Co-piloté par le CNRS et le CEA, le programme a comme objectif de séquencer le génome de 4 500 espèces marines avec une forte couverture des espèces de métropole mais en incluant aussi des espèces des territoires ultramarins. Les espèces choisies seront échantillonnées par le Projet Ciblé DIVE-Sea. Les échantillons seront confiés aux équipes du Projet Ciblé SEQ-Sea pour produire des assemblages de génome associés à des annotations structurales de haute qualité. Le projet ciblé BYTE-Sea s’appliquera à centraliser toutes les données de génomiques produites par le projet ATLASea dans un seul portail et à intégrer les génomes d'organismes connexes séquencés par d'autres consortia.
Le programme ATLASea déchiffrera et exploitera la mine colossale d'informations issues d’espèces marines du littoral Français. Il permettra de garantir l'interopérabilité et la sécurité des données, et de faciliter leur diffusion et leur utilisation conformément aux principes FAIR et Open Science. Financé à hauteur de 41,3 millions d’euros sur 8 ans dans le cadre de France 2030, il permettra entre autres de comprendre, de protéger et d’étudier l’ensemble des formes du vivant dans toute leur diversité.

En savoir plus

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Line Le Gall, professeure spécialiste en algues au MNHN et pilote du projet DIVE-Sea répond à nos questions sur le projet.